Impact of incomplete pedigree on breeding value estimation, genetic trends and heritability of pelt trait in Karakul sheep

Document Type : Research Paper

Author

Abstract

In order to evaluate the impact of the prediction Incomplete pedigree breeding value and genetic trends of Karakul sheep pelt, from real data collected at the Sarakhs of karakul sheep breeding station during the years 1995 to 2015 were used. Studied trait was: degree of Pelt that birth weight as auxiliary variables in the statistical model was used. For every trait, data from 21 years of selection and mating was saved in separate files. And the file of pedigree, sire’s number by 25% (from zero to one hundred percent) was removed randomly and data files for each trait in a state of complete and incomplete pedigree (removed 25, 50, 75 and 100% Number of Sires) under the animal model was used. Genetic trends of the pelt through regression of average breeding value on Birth year estimate that has to remove different percentages Numbers sire (0, 25, 50, 75 and 100 percent) from pedigree to were as follows: 0.0420 ± 0.0061, 0.0161 ± 0.0056, -0.0472 ± 0.031, 0.0161± 0.0056 and 0.0161 ± 0.0056. And heritability were, respectively: 0.74 ± 1.76, 0.72 ± 1.65, 0.71 ± 1.49, 0.73 ± 1.38 and 0.76 ± 1.25. The overall defect in pedigree by increasing percentage of elimination the number of sire, direct heritability reduced to 75% removal sire's number, then place the increase of heritability was the pelt as well as genetic trend by increasing the removal rate Sire Number fell.

Keywords


امام جمعه کاشان، ن. (1389) .برآورد پارامترهای ژنتیکی برخی صفات گوسفند قره‌گل سیاه، مجله علمی دانش کشاورزی، دوره 3 و 4، ص‌ص 89-79.
پهلوان افشاری،ک. و داودی، ج. (1395). شبیه سازی روند تغییرات ژنتیکی صفات رشد و هم خونی گوسفند نژاد زندی ایران. نشریه پژوهش های علوم دامی ایران، جلد 26، شماره2، ص‌ص 79-69.
حسنی، س.، امام وردی، ا.، زره داران، س.، آهنی آذری، م. و فرهنگ فر. ه. (1389). برآورد روند ژنتیکی، فنوتیپی و محیطی برخی صفات رشد و درجه پوست در گوسفند قره‌گل، مجله علوم دامی ایران، دوره41، شماره 4، ص‌ص 349-344.
شمسی الدینی نژاد، ه. و بحرینی بهزادی، م. ر. (1394). ارزیابی اثرات هم خونی بر برخی صفات اقتصادی در بز کرکی رائینی، مجله تحقیقات دام و طیور، جلد 4، شماره 3، ص‌ص 45-35.
طهمورث پور، م. و افتخارشاهرودی، ف.، سفیدبخت، ن. و ولی زاده، ر. (1373). تخمین پارامترهای ژنتیکی و فنوتیپی صفات اقتصادی در گوسفند قره‌گل، پایان نامه کارشناسی ارشد، دانشکده کشاورزی، دانشگاه فردوسی مشهد.
عباسی، م. ع.، آقایی، ا.، اسکندری نسب، م. پ. و جلای نوز، م. ج. (1389). تأثیر ساختار شجره  بر برآورد مولفه های واریانس و پارامترهای ژنتیکی صفت کمی در گوسفند. نشریه علوم دامی(پژوهش و سازندگی)، شماره 86،ص‌ص 36-31.
عباسی، م. ع. (1394). اثر اطلاعات پدری گمشده بر پیشرفت و روند ژنتیکی صفت کمی با استفاده از شبیه سازی رایانه ای، مجله پژوهشهای تولیدات دامی، شماره 12، ص‌ص 159-152.
Clement, V., Bibe, B.,Verrier, Jean-Michel. E. Elsen, Manfredi, E. Bouix. J. and Hanocq. E. (2001). Simulation analysis to test the influence of model adequacy and data structure on the estimation of genetic parameters for traits with direct and maternal effects. Genetics Selection Evolution. 33:369-395.
Greef, J.C., faure, A.S., Minnaar, G.J., Schoeman, S.J. (1993). Genetic trends of selection for pelt traits in Karakul sheep,I. direct responses. South African Society for Animal Science. 23:164-169..
Harder, B., Bennewitz, J., Reinsch, N., Mayer, M. and Kalm, E. (2005). Effect of missing sire information on genetic evaluation. Archives Animal Breeding, Archiv Tierzucht. 48:219-232.
Madsen, P. and Jensen. J. (2008). DMU. A Package for Analysing Multivariate Mixed Models, A User's Guide to DMU, , University of Aarhus Research Centre Foulum , Denmark ,Version 6, release 5.2.
Mirhoseini, S.Z., Zare, J., GhaviHossein-Zadeh,N., Khanzadeh.H., Seidavi.A., Laudadio.V. and et al. (2015). Estimation of genetic parameters for body weight traits and pelt quality score in Iranian Karakul sheep. Small Ruminant Research. 132:67–71.
Nilforooshan, M.A., Khazaeli, A. and Edriss, M.A. (2008). Effects of missing pedigree information on dairy cattle genetic evaluations (short communication). Archives Animal Breeding, Archiv Tierzucht. 51:99-110.
Sanders, K., Bennewitz, J. and Kalm, E. (2006). Wrong and missing sire information affects genetic gain in the Angeln dairy cattle population. Journal of Dairy Science. 89:315-321
Schoeman, S.J. and Albertin, J.R. (1993). An evaluation of the subjective categorization of hair quality of pelt traits in Karakul Lambs. South African Journal of Animal Science. 23:88-91.
Vatankhah, M., MoradiShahrBabak, M., NejatiJavaremi, A., MiraeiAshteiani, S.R. and VaezTorshizi. (2004). Review on sheep breeding in Iran. First congress on animal science and aquatic, Tehran University, Karaj, Iran.
Muchadeyi, F.C., Malesa, M.T., Soma, P. and Dzomba, E.F. (2010). Runs of homozygosity in  SWAKARA pelt producing sheep: Implications on SUB-VITAL performance. Proceeding of Association for the Advancement of Animal Breeding and Genetics. 21:310-313.