بررسی چندشکلی تعدادی از جایگاه‌های ریز‌ماهواره‌ای کروموزوم 3 و ارتباط آن‏ها با تولید پشم در گوسفند بلوچی

نوع مقاله : مقاله پژوهشی

نویسندگان

1 دانشجوی دکتری گروه علوم دامی، دانشکده علوم دامی و صنایع غذایی، دانشگاه کشاورزی و منابع طبیعی رامین خوزستان

2 دانشیار گروه علوم دامی، دانشکده علوم دامی و صنایع غذایی، دانشگاه کشاورزی و منابع طبیعی رامین خوزستان.

3 استاد گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه فردوسی مشهد.

4 دانشجوی دکتری پژوهشکده زیست فناوری، دانشکده کشاورزی دانشگاه شیراز

5 استادیار، گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه زابل

چکیده

در این مطالعه چندشکلی‏ چهار جایگاه ریزماهواره‏ای BMS1915، BMS1350، LGB وILSTS45 در کروموزوم 3 و ارتباط آن‏ها با صفت وزن پشم در گوسفندان بلوچی مورد بررسی قرار گرفت. به این منظور استخراج DNA از نمونه‏های خون جمع‏آوری شده از 185 رأس گوسفند نژاد بلوچی ایستگاه عباس آباد مشهد انجام شد. قطعات ژنی مربوط به جایگاه‌های ریزماهواره‌ای توسط واکنش زنجیره‌ای پلی‌مراز و با استفاده از آغازگرهای اختصاصی تکثیر شدند. نتایج نشان داد آلل E در جایگاه BMS1915 با 40/0، آللD در جایگاه BMS1350 با 30/0، آلل B در جایگاه LGB با 48/0 و آلل A در جایگاه ILSTS45 با 46/0 دارای بیشترین فراوانی بودند. نتایج مقایسه میانگین نشان داد جایگاه ریزماهواره LGB دارای بیشترین میزان تولید پشم و جایگاه ریزماهواره ILSTS45 دارای کمترین میزان تولید پشم می باشد. همچنین درجایگاه LGB ژنوتیپ AC دارای بیشترین (7/95± 1308 گرم) و ژنوتیپ BC دارای کمترین (7/54±875 گرم) میزان تولید پشم است. با مقایسه ضریب تغییرات 4 جایگاه مشخص شد که بیشترین تنوع و پراکندگی مربوط به جایگاه ریزماهوارهILSTS45 و کمترین میزان تنوع مربوط به جایگاه BMS1350 می باشد. از طریق آزمون کای مربع مشخص شد همه جایگاه‏ها در تعادل هاردی-واینبرگ قرار دارند (05/0(P>. ارزیابی نتایج آنالیزهای آماری نشان داد چند شکلی جایگاه‌های مورد مطالعه با تولید پشم در گوسفندان بلوچی ارتباط معنی‏داری ندارند (05/0(P> . بنابراین نتیجه‌گیری می‌شود که با انجام تحقیقات بعدی در زمینه مطالعات مبتنی بر انتخاب بر اساس نشانگرهای مولکولی، می‌توان ارتباط این جایگاه‌‌ها را با سایر صفات در گوسفند بلوچی مورد بررسی قرار داد.

کلیدواژه‌ها


  1. محمدی، ح. رافت، س. ع. مرادی شهر بابک، ح. شجاع، ج. و مرادی، م. ح. (1396). مطالعه ساختار و لایه بندی جمعیتی و ارتباط ژنومی هاپلوتایپی صفات کیفی پشم در گوسفندان نژاد زندی. نشریه پژوهش های علوم دامی. شماره 2، ص ص. 193-204
  2. ولی زاده، ر. نصیری، م. اسلمی نژاد، ع.ا. داشاب، غ. ساقی، د. ع. قلی زاده، م. (1391). بررسی تنوع ژنتیکی چهار جایگاه میکروستلایت BMS1915، BMS1350، LGB وILSTS45 در گوسفندان بلوچی. نشریه پژوهش های علوم دامی ایران. شماره 1، ص ص. 61-56
  1. Agha, S. H., Pilla, F., Galal, S., Shaat, I., D'Andrea, M., Reale, S., Abdelsalam, A. Z. and Li, M. H.  (2008). Genetic diversity in Egyptian and Italian goat breeds measured with microsatellite polymorphism. J Anim Breed Genet.42:245-253
  2. Aljumaah, R.S., Al-Shaikh, M.A., Kibogo, H., Kwallah, A., Jianlin, H., Hanotte, O., Musthafa, M.M.  and Marikar, F.M.M.T. (2014). Genetic Relationships among Four Saudi Arabian Sheep Populations. Iranian Journal of Applied Animal Science, Volume: 4; Number: 4; Pages: 775-779.
  3. Cho, G. J. and Cho, B. W. (2004). Microsatellite DNA typing using 16 markers for parentage verification of the Korean native horse. Asian-Australasian Journal of Animal Sciences 17(6):750-754.
  4.  Crispim, B.A., Seno, L.O., Andréa Alves do Egito, A.A.,  Junior, F.M.V. and  Grisolia, A.B. (2014). Application of microsatellite markers for breeding and genetic conservation of herds of Pantaneiro sheep. Electronic Journal of Biotechnology. 17(6): 317–321.
  5. DoksO, A., Kelava, N., Brka, M. and Ivankovic, A. (2011). the effect of LGB gene on quantitative and qualitative characterization of milk Holstein breed in croativ. In: Proceedings - 2:1d International Scientific-Expert Conference of Agriculture and Food Industry - Sarajevo
  6. Eveline, M., Awemu, I., Kgwatalala, P. and Zhao, X. (2008). A critical analysis of production-associated DNA polymorphisms in the genes of cattle, goat, sheep, and pig. mammalian Genome. 19:591–617
  7. Forrest, RH., Hickford, JG., Wynyard, J., Merrick, N., Hogan, A. and Frampton. C. (2006).  Polymorphism at the beta-adrenergic receptor (ADRB3) locus of Merino sheep and its association with lamb mortality. Animal Genetics. 37(5):465-8.
  8. Ismail khanian, S., Nejati javaremi, A., Afraz, F., Daneshyar P. and Ghanbari, S. (2007). investigate genetic variation in Baluchi sheep using microsatellite markers. Agricultural Sciences and Natural Resources. 41:373-379
  9. Julius, H.J. and Werf, V. (2006). Marker-assisted selection in sheep and goats. Science Publishers, INC. USA.pp:25-32
  10. Karimi, K., Beigi Nassir, MT., Mirzadeh, K. I., Ashayerizadeh, A., Roushanfekr, H. and Fayyazi, J. (2009). Polymorphism of the β-lactoglobulin gene and its association with milk production traits in Iranian Najdi cattle. Iranian journal of biotechnology. 7:82-85
  11. Li, X. L., Gong, Y. F., Zhang, J. W., Liu, Z. Z. and Valentini, A. (2004). Study on polymorphisms of microsatellites DNA of six Chinese indigenous sheep breeds. Yi Chuan Xue Bao. 31(11):1203-10.
  12. Liu, GF., Tian, K.C., Zhang, E.P., Huang, X.X. and Zhang, Y.H. (2007). Candidate gene analysis of high-quality merino sheep. Yi Chuan Chinese. 29(1):70-4.
  13.  Miah, M., Y. Rafii, M.,  R. Ismail, M.,  B. Puteh, A.,  A. Rahim, H.,  Islam, K.N. and Abdul Lati, M. (2013). A Review of Microsatellite Markers and Their Applications in Rice Breeding Programs to Improve Blast Disease Resistance. International Journal of Molecular Sciences. 14(11): 22499–22528.
  14. Nagarajan, M., Kumar, N., Nishanth, G., Haribaskar, R., Paranthaman, K., Gupta, J., Mishra, M., Vaidhegi, R., Kumar, S., Ranjan, S.K. and Kumar, S. (2009). Microsatellite markers of water buffalo, Bubalus bubalis - development, characterization and linkage disequilibrium studies, BMC Genetics, 10:68- 79
  15. Nane karani, s., Amiri niya, s., Amir Mozafari, N., Vaez torshizi, R. and Ghare daghi, A.A. (2010). investigate genetic variation in Zandi sheep population using microsatellite markers. journal of veterinary medicine. 11:80-86
  16. Pariset, L., Savarese, M.C., Cappuccio, I. and Valentini, A. (2003). Use of microsatellites for genetic variation and inbreeding analysis in Sarda sheep flocks of central Italy. Journal of Animal Breeding and Genetics. 120:213-216
  17. Maddox, JF., Davies, KP., Crawford, AM., Hulme, D.J., Vaiman, D., Cribiu, E.P., Freking, B.A., Beh, K.J., Cockett, N.E., Kang, N., Riffkin, C.D., Drinkwater, R., Moore, S.S., Dodds, K.G., Lumsden, J.M., Van Stijn, T.C., Phua, S.H., Adelson, D.L., Burkin, H.R., Broom JE, Buitkamp J, Cambridge L, Cushwa WT, Gerard E, Galloway SM, Harrison B, Hawken, R.J., Hiendleder, S., Henry, H.M., Medrano, J.F., Paterson ,K.A., Schibler, L., Stone, R.T. and Van Hest, B. (2001) An enhanced linkage map of the sheep genome comprising more than 1000 loci. Genome research. 11(7):1275-89.
  18. Dominik, S., Hunt, P.W., McNally, J., Murrell, A., Hall, A. and Purvis, I.W. (2010). Detection of quantitative trait loci for internal parasite resistance in sheep. I. Linkage analysis in a Romney x Merino sheep backcross population. Parasitology. 137(8):1275-82.
  19. Lan, X.Y., Pan, C.Y., Li, J.Y., Guo, Y.W., Hu, S., Wang, J., Liu, Y.B., Hu, S.R., Lei, C.Z. and Chen, H. (2009). Twelve novel SNPs of the goat POU1F1 gene and their associations with cashmere traits. Small Ruminant Research. 85: 116-121.
  20. Roldan, D.L., Dodero, A.M., Bidinost, F., Taddeo, H.R., Allain, D., Zhang, M. and Li, S. (2010). Merino sheep: a further look at quantitative trait loci for wool production. Animal. 4: 1330–1340.
  21. Miluchová, M., Trakovická, A. and Gábor, M. (2011). Polymorphism and genetic structure of lgb gene (rsai) in valachian sheep population. Animal science and biotechnology. 44(1): 98-110.