نوع مقاله : مقاله پژوهشی
نویسندگان
1 دانش آموخته دکترای گروه علوم دامی، دانشکده علوم و صنایع غذایی، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی خوزستان، ملاثانی، ایران.
2 استاد گروه علوم دامی، دانشکده علوم و صنایع غذایی، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی خوزستان، ملاثانی، ایران.
3 استادیار بخش پژوهش‌های بیوتکنولوژی، موسسه تحقیقات علوم دامی کشور، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، کرج، ایران.
4 استادیار گروه علوم دامی، دانشکده علوم و صنایع غذایی، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی خوزستان، ملاثانی، ایران.
چکیده
کرچی یک رفتار مادری و غریزه طبیعی در پرندگان است که تولید تخم را مهار میکند. بوقلمون یکی از پرندگانی است که بروز کرچی ممکن است بخش عمده ای از طول عمر اقتصادی آن را شامل شده و و سودآوری اقتصادی صنعت پرورش آن را به میزان قابل توجهی تاثیر قرار دهد. زمینه ژنتیکی و عوامل محیطی و مدیریتی موثر بر بروزکرچی در طیور بخوبی شناسایی و به طور گسترده مورد مطالعه قرار گرفتهاند. اما سازوکار تنظیم مولکولی آن بطور کامل مشخص نیست. در مطالعه حاضر ترانسکریپتوم هیپوفیز بوقلمون مادر تجاری از نژاد بیوتی طی مراحل تخمگذاری و کرچی مورد بررسی قرار گرفت. تعداد 334 ژن متفاوت بیان شده بین دو گروه تشخیص داده شد، که 229 ژن دارای بیان زیاد و 105 ژن دارای بیان کم در گروه تخمگذار در مقایسه با گروه کرچ مشاهده شد. در این مطالعه نتایج آنالیز عملکرد ژنها با استفاده از پایگاه KEGG نشان داد که ژنهای مسیر پردازش پروتئین در شبکه آندوپلاسمی نقش موثری در کنترل کرچی بوقلمونها داشتند (P <0.05). آنالیز شبکه ژنی نشان داد که ژنهای CANX، HSPA8، P4HB، HSPBP1 و ATF4 ممکن است به عنوان تعدیل کنندههای مهم هورمونی و سازوکارهای رفتاری مرتبط با کرچی عمل کنند.
کلیدواژه‌ها
- Anders, S., Pyl, PT., Huber, W. (2014). HTSeq - A Python framework to work with highthroughput sequencing data. Bioinformatics. 31(2):166–9.
Andrews, S. (2010). FastQC: a quality control tool for high throughput sequence data. Available online:http://bioinformatics.Babraham.ac. uk/projects/fastqc.
Anne McNabb, FM. (2007). The Hypothalamic-Pituitary-Thyroid (HPT) Axis in Birds and Its Role in Bird Development and Reproduction. Critical Reviews in Toxicology, 37:163–193. DOI: 10.1080/10408440601123552
Bedrak, E., Harvey, S., Chadwick, A. (1991). Concentration of Pituitary, Gonadal and Adrenal Hormones in Serom of Laying and Broody White Rock Hens (Gallus Domesticus). J. Endocrinology. 89, 197-204.
Bolger, A., Lohse, M., Usadel, B. (2014) Trimmomatic: a flexible trimmer for Illumina sequence data. Bioinformatics Bioinformatics, 30(15):2114-20.
Campos, JL., Doratioto, O., Tabata R., Bernardi Videira, N., Veras Ribeiro, H., Batista, F. and et al. (2019). Protein Disulfide Isomerase Modulates the Activation of Thyroid Hormone Receptors. Frontiers in Endocrinology | www.frontiersin.org. Volume 9 Article 784.
El Halawani, M. E., Burke, W. H. Dennison, P. T. (1980). Effect of nest deprivation on serum prolactin level in nesting female turkeys. Biol. Reprod. 23:118–123.
El Halawani, M. E., Silsby, J. L., Behnke, E. J Fehrer, S. C. (1984). Effect of ambient temperature on serum prolactin and luteinizing hormone levels during the reproductive life cycle of the female turkey (Meleagris gallopavo). Biol. Reprod. 30:809–815.
Hamzic, E. Kjaerup, R.B., Mach, N., Minozzi, G., Strozzi, F., Gualdi, V. and et al.
(2016). RNA sequencing-based analysis of the spleen transcriptome following infectious bronchitis virus infection of chickens selected for different mannose binding lectin serum concentrations. BMC Genomics 17:82.
Kezele, P., Skinner, M. K. 2003. Regulation of ovarian primordial
follicle assembly and development by estrogen and progesterone: endocrine model
of follicle assembly. Endocrinology 144:3329–3337.
Liu, H., Wang, J., Li, L., Han, C., He, H., Xu, H. (2018). Transcriptome analysis revealed the possible regulatory pathways initiating female geese broodiness within the hypothalamic-pituitarygonadal axis. PLOS ONE https://doi.org/10.1371/journal.pone.0191213.
Liu, L., Xiao, Q. Gilbert, E R., Cui, Z., Zhao, X., Wang, Y. and et al. (2018). Whole transcriptome analysis of atrophic ovaries in broody chickens reveals regulatory pathways associated with proliferation and apoptosis apoptosis. Scientific Reports 8:7231.
Lin, X., Liu, X., Ma, Y., Mi, Y., Zeng, W., Li, J., Zhan, C. (2018). Coherent apoptotic and autophagic activities involved in regression of chicken postovulatory follicles. AGING Vol. 10, No. 4
Kim, D., Langmead, B. Salzberg, S. L. (2015) HISAT: a fast spliced aligner with low memory requirements. Nature methods 12:357-360.
Onchere, X., Godbert, SR., Antier, CH., Cabau, C., Sibut, V., Cogburn LA. and et al. (2010). Gene expression profiling to identify eggshell proteins involved in physical defense of the chicken egg. BMC Genomics. 11:57
Proudman, J. A., Opel, H. (1981). Turkey prolactin: validation of a radioimmunoassay and measurement of changes associated with broodiness. Biol. Reprod. 25:573–580.
Porter, T. E., Hargis, B. M., Silsby, J. L., El Halawani, M. E. (1989). Differential steroid production between theca interna and theca externa cells: a three-cell model for follicular steroidogenesis in avian species. Endocrinology 125:109–116.
Reddy Bonam, S., Ru, M., Muller, S. (2019). HSPA8/HSC70 in Immune Disorders: A Molecular Rheostat that Adjusts Chaperone-Mediated Autophagy Substrates. journal cells. 8: 849.
Regina, T. Knapp, RT., Wong, MJH., Kollmannsberger, LK., Gassen, NC., Kretzschmar, A., and et al (2014). Hsp70 Cochaperones HspBP1 and BAG-1M DifferentiallyRegulate Steroid Hormone Receptor Function. PLOS ONE. 9,1: 85415.
Ritchie, ME., Phipson, B., Wu, D., Hu, Y., Law, CW., Shi, W. and et al. (2015) Limma powersdifferential expression analyses for RNA-sequencing and microarray studies.Nucleic Acids Res. 2015;43(7):e47
Rual, JF., Venkatesan, K., Hao, T., Hirozane-Kishikawa, T., Dricot, A., Li, N. and et al. (2005). Towards a proteome-scale map of the human protein-protein interaction network. Nature. 437 (7062): 1173–8.
Schwarz, DS., Blower, MD. (2016). The endoplasmic reticulum: structure, function and response to cellular to signaling. Cell. Mol. Life Sci. 73:79–94.
Tang, E. Song, B. Yin, J. Xu, J., Bao, E. (2018). Rosemary Reduces Heat Stress by Inducing CRYAB and HSP70 Expression in Broiler Chickens. Oxidative Medicine and Cellular Longevity, Volume 2018, Article ID 7014126, 10 pages
Ye, P., Ge, K., Li, M., Yang, L., Jin, S. Zhang, C., Chen, X., Geng, Z. (2019). Egg-laying and brooding stage-specific hormonal response and transcriptional regulation in pituitary of Muscovy duck (Cairina moschata). Poultry Science 98:5287–5296.
Yu, J., Lou, Y., He, K., Yang, S., Yu, W., Han, L., Zhao, A. (2016). Goose broodiness is involved in granulosa cell autophagy and homeostatic
imbalance of follicular hormones. Poultry Science 95:1156–1164
Yu, J., Lou, Y., Zhao, A. (2016). Transcriptome analysis of follicles reveals the importance of autophagy and hormones in regulating broodiness of Zhedong white goose. Scientific Reports 6:36877.
)