نوع مقاله : مقاله پژوهشی

نویسندگان

1 کارشناسی ارشد ژنتیک و اصلاح دام، گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه زابل، زابل، ایران

2 دانشیار ژنتیک و اصلاح دام، گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه زابل، زابل، ایران

3 ژنتیک و اصلاح دام، گروه علوم دامی و بیوانفورماتیک، دانشکده کشاورزی، دانشگاه زابل، زابل، ایران

چکیده

هدف از این مطالعه شناسایی QTL‌های صفات وزن بدن روی کروموزوم 3 بلدرچین ژاپنی در قالب طرح تلاقی چهار نسلی بر پایه دی‌آلل کراس بود. بدین منظور چهار سویه Wild، A and M Texas، Italian و Tuxedo بلدرچین ژاپنی دو به دو و رفت و برگشتی تلاقی داده شده و نسل اول ایجاد شد. سپس از تلاقی پرندگان آمیخته نسل اول، نسل‌های بعدی شامل دوم، سوم و چهارم ایجاد شدند. داده‌های فنوتیپی شامل اندازه‌گیری‌های وزن بدن از تولد تا 45 روزگی با فاصله ۵ روز در نتاج حاصل از والدین انتخابی نسل چهارم بودند. والدین نسل سوم و چهارم و کل پرندگان حاصل از والدین انتخابی نسل چهارم (369 پرنده) برای سه نشانگر ریزماهواره‌ای واقع بر کروموزوم 3 تعیین ژنوتیپ شدند. برآورد اثرات نشانگرها و مؤلفه‌های واریانس QTL با سه مدل افزایشی، غالبیت و افزایشی-غالبیت نشانگرها با رویه AI-REML نرم‌افزار GVCBLUP انجام شد. در برآورد آثار نشانگرها نقطه‌ای که بالاترین میزان آماره F را دارا بود به عنوان مکان QTL گزارش شد. نتایج این تحقیق بیانگر وجود حداقل یک مکان ژنی (QTL) با اثرات افزایشی مرتبط با صفات وزن 5، 10، 20 و 40 روزگی در ابتدای کروموزوم و برای صفات هچ، 15، 25، 30، 35 و 45 روزگی در موقعیت 38 سانتی‌مورگان کروموزوم 3 بودند. همچنین در مدل غالبیت QTL‌های معنی‌دار برای اکثر صفات به جز 25 و 35 روزگی در ابتدای کروموزوم 3 قرار داشتند. درصد تغییرات بواسطه اثرات افزایشی و غالبیت نشانگر‌‌‌ها در تظاهر فنوتیپی صفات وزن بدن در دامنه 3/1 تا 7/8 درصد قرار داشت.

کلیدواژه‌ها

ایرانمنش،م.، اسمعیلی زاده، ع. و محمدآبادی، م. (1396)0 نقشه‌یابی جایگاه‌های ژنی مرتبط با وزن بدن روی کروموزوم شماره 5 در یک جمعیت F2 بلدرچین ژاپنی. پژوهشهای تولیدات دامی، 9(22): 118-111.
جباری عوری، ر.، اسمعیلی زاده کشکوئیه، ع.، چراتی، ه. و آیت الهی مهرجر دی، ا. (a1392). مکان یابی جایگاه های ژنی مرتبط با اجزای لاشه روی کروموزوم شماره 3 در بلدرچین ژاپنی. هشتمین همایش بیوتکنولوژی جمهوری اسلامی ایران و چهارمین همایش ملی امنیت زیستی، تهران.
جباری عوری، ر.، اسمعیلی زاده کشکوئیه، ع.، چراتی، ه. و محمدآبادی، م. (b1392). مکان­یابی جایگاه­های ژنی مرتبط با سرعت رشد اولیه و نسبت کلیبر روی کروموزوم شماره 3 بلدرچین ژاپنی. هشتمین همایش بیوتکنولوژی جمهوری اسلامی ایران و چهارمین همایش ملی امنیت زیستی، تهران.
چراتی، ه.، اسمعیلی زاده کشکوئیه، ع.، جباری عوری، ر. و آیت اللهی مهرجردی، ا. (1392). مکان یابی جایگاه های ژنی مرتبط با انواع گلبول های سفید، دمای بدن و بهت زدگی در بلدرچین ژاپنی. ژنتیک نوین، 9(1): 66-57.
سهرابی، س.، اسماعیلی زاده، ع.، محمد آبادی، م. و مرادیان، ح. (1392). شناسایی جایگاه های ژنی مؤثر بر نسبت کلیبر در یک جمعیت از آمیخته های حاصل از تلاقی دو سویه بلدرچین ژاپنی. مجله بیوتکنولوژی کشاورزی، 6(1): 122-111.
سهرابی، س.، اسماعیلی زاده، ع.، محمد آبادی، م.، مرادیان، ح.، نصیری فر، ا.، و خدابخش‌زاده. (1395). شناسایی جایگاه‌های ژنی مؤثر بر عدم تقارن اسکلتی در بلدرچین ژاپنی. مجله بیوتکنولوژی کشاورزی، 8(4): 84-69.
مرادیان، ح.، اسماعیلی زاده، ع.  و محمدآبادی، م. 1391. نقشه­یابی ریزماهواره­ای جایگاه صفات کمّی مرتبط با صفات لاشه روی کروموزوم شمارۀ یک بلدرچین ژاپنی. تولیدات دامی، 15(2): 99-89.
مرادیان، ح.، اسماعیلی زاده، ع.، محمدآبادی، م. و سهرابی، س. (1393). شناسایی جایگاه­های ژنی مرتبط با وزن و نسبت اندام­های داخلی بدن روی کروموزوم شماره 1 بلدرچین ژاپنی. مجله بیوتکنولوژی کشاورزی، 6(4): 158-143.
Baron, E. E., Moura, A.S.A.M.T., Ledur, M.C., Pinto, L.F.B., Boschiero, C., Ruy, D.C. and Coutinho, L.L. (2011). QTL for percentage of carcass and carcass parts in a broiler x layer cross. Animal Genetics, 42 (2): 117-124. ‏
Botstein, D., White, R.L., Skolnick, M. and Davis, R.W. (1980). Construction of a genetic linkage map in man using restriction fragment length polymorphisms. American Journal of Human Genetics, 32(3): p.314.
Esmailizadeh, A.K., Baghizadeh, A. and Ahmadizadeh, M. (2012). Genetic mapping of quantitative trait loci affecting bodyweight on chromosome 1 in a commercial strain of Japanese quail. Animal Production Science, 52 (1): 64-68.
Gao, F.Y., Lu, X.J., Wang, W.M., Sun, S.S., Li, Z.H., Li, H.J. and Ren, G.J. (2009). Trait-specific improvement of a cytoplasmic male sterile line using molecular marker-assisted selection in rice. Crop Science, 49: 99–106.
Iranmanesh , M., Esmailizadeh , A., Mohammad Abadi, M.R., Zand , E., Mokhtari, M.S. and Wu. D.D. (2016). A molecular genome scan to identify DNA segments associated with live weight in Japanese quail. Molecular Biology Reports. 43(11): 1267-1272.
Jabbari, R., Esmailizadeh, A.K., Charati, H., Mohammadabadi, M.R. and Sohrabi, S.S. (2014). Identification of QTL for live weight and growth rate using DNA markers on chromosome 3 in an F2 population of Japanese quail. Molecular Biology Reports, 41: 1049-1057.
Kayang, B.B., Vignal, A., Inoue‐Murayama, M., Miwa, M., Monvoisin, J.L., Ito, S. and Minvielle, F. (2004). A first‐generation microsatellite linkage map of the Japanese quail. Animal Genetics, 35 (3): 195-200. ‏
Liu, K. and Muse, S.V. (2005). PowerMarker: An integrated analysis environment for genetic marker analysis. Bioinformatics, 21: 2128-2129.
Lu, D., Akanno, E.C., Crowley, J.J., Schenkel, F., Li, H., De Pauw, M. and Plastow, G. (2016). Accuracy of genomic predictions for feed efficiency traits of beef cattle using 50K and imputed HD genotypes. Journal of Animal Science, 94(4): 1342-1353.
Minvielle, F., Kayang, B.B., Inoue-Murayama, M., Miwa, M., Vignal, A., Gourichon, D. and Ito. S.I. (2005). Microsatellite mapping of QTL affecting growth, feed consumption, egg production, tonic immobility and body temperature of Japanese quail. BMC Genomics, 6 (1): 87. ‏
Nasirifar, E., Talebi, M., Esmailizadeh, A.K., Moradian, H., Sohrabi, S.S. and Askari, N. (2016). A chromosome-wide QTL mapping on chromosome 2 to identify loci affecting live weight and carcass traits in F2 population of Japanese quail. Czech Journal of Animal Science, 61(6): 290–297.
Navani, N., Jain, P.K., Gupta, S., Sisodia, B.S. and Kumar, S. (2002). A set of cattle microsatellite DNA markers for genome analysis of riverine buffalo (Bubalus bubalis). Animal Genetics, 33(2): 149-154.
Navarro, P., Visscher, P.M., Knott, S.A., Burt, D.W., Hocking, P.M. and Haley, C.S. (2005). Mapping of quantitative trait loci affecting organ weights and blood variables in a broiler layer cross. British Poultry Science, 46(4): 430-442.
Recoquillay, J., Pitel, F., Arnould, C., Leroux, S., Dehais, P., Mor´eno, C., Calandreau, L., Bertin, A., Gourichon, D., Bouchez, O., Vignal, A., Fariello, M., Minvielle, F., Beaumont, C., Leterrier, C. and E. Le Bihan-Duval, E. (2015). A medium density genetic map and QTL for behavioral and production traits in Japanese quail. BMC Genomics, 16: 10.
Vollmar, S., Haas, V., Schmid, M., Preu, S., Joshi, R., Rodehutscord, M. and Bennewitz, J. (2020). Mapping genes for phosphorus utilization and correlated traits using a 4k SNP linkage map in Japanese quail (Coturnix japonica). Animal Genetics, 52: 90–98.
Wang, S., Dvorkin, D. and Da, Y. (2012). SNPEVG: a graphical tool for GWAS graphing with mouse clicks. BMC Bioinformatics, 13(1): 319.
Weller, J.I. (2001). Quantitative trait loci analysis in animals. New York: CABI Publishing.
Xu, H.M., Wei, C.S., Tang, Y.T., Zhu, Z.H., Sima, Y.F. and Lou, X.Y. (2011). A new mapping method for quantitative trait loci of silkworm. BMC Genetics, 12 (1): 19.
Yeh, F.C., Yang, R. and Boyle, T. (1999). POPEGENE. Version 1.31. Microsoft Window–based Freeware for Population Genetic Analysis, University of Alberta. Edmonton.
Zane, L., Bargelloni, L. and Patarnello, T. (2002). Strategies for microsatellite isolation: a review. Molecular Ecology, 11 (1): 1-16.